Для Debian 13 пакет R доступен в официальном репозитории. Сторонний ключ CRAN не нужен, если вам не требуется более новая ветка, чем поддерживает Debian.

1. Установите R и инструменты сборки

sudo apt update
sudo apt full-upgrade -y
sudo apt install -y r-base r-base-dev build-essential

2. Проверьте R

R --version
Rscript -e 'sessionInfo()'

3. Создайте пользовательскую библиотеку

mkdir -p ~/R/library
echo 'R_LIBS_USER=~/R/library' >> ~/.Renviron

4. Установите пакет без root

Rscript -e 'install.packages("jsonlite", repos="https://cloud.r-project.org")'

Проверка результата

Rscript -e 'library(jsonlite); packageVersion("jsonlite")'

Официальная документация